中國科學院文獻情報中心發布的網絡數據庫目錄來源期刊每兩年會篩選一次，篩選過程是通過定量與定性結合的方式，從中國科學引文數據庫中進行定量分析，再由國內專家對期刊進行定性分析，最終收錄于中國科學中心網絡數據庫，以下是收錄的期刊目錄。

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　　CNKI會議和報紙數據庫

　　CNKI社科類期刊和博碩士學位論文數據庫

　　CNKI科技類期刊和博碩士學位論文庫

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　　CSA劍橋科學文摘數據庫

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　　Emerald回溯

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　　方正中文電子圖書

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　　國家哲學社會科學學術期刊數據庫(NSSD)

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　　InCites

　　Index Chemicus

　　Intech開放資源

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　　IOP 出版社合作出版的14種期刊

　　IOP(2003-2007)

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　　加拿大農業學會

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　　Karger期刊回溯庫

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　　開放獲取期刊指南

　　科學公共圖書館開放獲取期刊

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　　MAL 期刊回溯庫

　　MathSciNet《數學評論》數據庫

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　　MSP數學科學出版社數據庫

　　美國Mary Ann Liebert出版公司

　　美國伯克利電子出版社

　　美國農業生物工程師學會電子期刊

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　　美國冷泉港實驗室實驗方案

　　美國冷泉港實驗室期刊

　　美國動物學會

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　　美國遺傳學學會期刊

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　　NRC期刊回溯庫

　　牛津期刊過刊回溯庫

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　　ProQuest Ebook Central-國科大

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　　生物醫學中心開放獲取期刊

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